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    chi-biotech 细菌/真菌重测序

      


      


      细菌/真菌基因组重测序主要是针对有参考基因组的物种进行测序,用于检测基因序列间的位点差异和结构变异,即检测发现单核苷酸多态性位点( SNP)、插入( Insertion)、缺失( Deletion)等变异类型。




    技术路线



    技术参数



    样本类型:基因组DNA,样本总量≥2 μg,样本浓度:≥50 ng/μL
    测序策略:HiSeq PE150,推荐测序深度:100X
    项目周期:30个工作日



    生物信息分析内容



    细菌重测序

    真菌重测序

    1. 数据质控

    2. 初级组装

    3. 与参考基因组比对

    4. SNP、Indel、SV检测及注释

    5. 物种进化分析(系统发育树、Ka/Ks分析)


    1. 数据质控

    2. 与参考基因组比对

    3. SNP、Indel、SV检测及注释

    4. 物种进化分析(系统发育树、Ka/Ks分析)








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